JaLTERの経費は各サイトからの会費そのほかの収入をもってあてる。 会費の徴収方法については、細則により別に定める。
JaLTER会計年度は毎年1月1日に始まり、12月末日に終る。
経費については執行部が管理、執行することとする。 予算、決算に関わる詳細事項は、適正な会計監査に基づき、代表者委員会で承認されなくてはならない。
本会に対する寄付または補助金などは代表者委員会の議を経て代表がこれを受けることができる。